اين دانشنامه در سه مجلد و سي فصل به صورت موضوعي سامان يافته است و در تدوين آن سعي شده مقالات هر مجلد از حيث موضوع با يكديگر مرتبط باشد. تأليف هر مقاله را متخصصان طراز اول در هر رشته در جهان بر عهده داشته‌اند. از ويژگيهاي اين اثر ابتكاري و ممتاز كه بي‌ترديد مهمترين و معتبرترين تأليف نوشته شده تاكنون درباره علوم دوره اسلامي است، علاوه بر ساختار دقيق، نثر متعارف و معيار دايره‌المعارفي، غناي ارجاعات كتابشناختي، استواري و اتقان علمي مقالات، فهرست موضوعات و اعلام و كتابهاي آن است. امتياز ديگر اين اثر، كتابشناسي تفصيلي و تخصصي تاريخ علم در پايان هر مجلد و براساس موضوعات است كه خوانند را با پژوهشهاي جديد و منابع مربوط به هر رشته آشنا مي‌كند.